Bioinformatics / Genomics – NVIDIA 技術博客
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Thu, 02 Nov 2023 06:46:17 +0000
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借助 NVIDIA Parabricks v4.2 加速任何測序器的基因組分析
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/accelerate-genomic-analysis-for-any-sequencer-with-parabricks-v4-2/
Mon, 30 Oct 2023 06:40:50 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=8081
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Parabricks 4.2 版現已發布，進一步推進了其使命，即在基因組學測序分析中提供前所未有的速度、成本效益和準確性。最新版本為 Oxford Nanopore 測序提供了新的加速工作流程(在精選圖像中)，使 Parabricks 能夠在最新的 NVIDIA GPU 上運行，并進一步推進了 Parabricks 的加速深度學習變體識別計劃，以支持來自所有主要測序器類型的數據類型。 Parabricks v4.2 包含了升級的 WDL 和 NextFlow 工作流，這被視為部署 Parabricks 工具的最佳實踐。您可以在 Parabricks 工作流程 GitHub 庫中找到，包括短讀和長讀工作流。 最新版本的 Parabricks 提供更新的 Oxford Nanopore 種系工作流，可在 NVIDIA H100 GPU 上提供高速分析。
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