醫學影像學 – NVIDIA 技術博客
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Thu, 30 Nov 2023 06:43:41 +0000
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借助 NVIDIA MONAI Cloud API 加速 3D 醫學影像的 AI 工作流
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/accelerate-ai-workflows-for-3d-medical-imaging-with-nvidia-monai-cloud-apis/
Sun, 26 Nov 2023 06:41:06 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=8371
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AI 越來越多地用于改善醫學成像,以進行健康篩查和風險評估。例如,醫學影像分割可為腫瘤檢測和治療規劃提供重要數據。然而,醫學影像的獨特性和多樣性使得實現一致、可靠的結果具有挑戰性。 NVIDIA MONAI Cloud API 幫助解決這些挑戰,簡化了平臺集成商的 AI 功能和基礎設施設置之旅。本文介紹了 NVIDIA MONAI Cloud API、VISTA-3D 和 Auto3DSeg,并解釋了如何同時使用它們來實現自適應 3D 醫學成像。 NVIDIA MONAI Cloud API 可提供低延遲、交互式且經濟高效的 AI 輔助標注工作流。借助持續學習機制,該模型可適應新的真實數據,使其能夠隨著時間的推移保持相關性和可靠性。 VISTA-3D 基于大量數據集進行訓練,是用于 3D 醫學成像的專用交互式基礎模型。VISTA – 3D 為 NVIDIA…
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在 NVIDIA DGX 上以細胞分辨率繪制全人腦神經映射
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/whole-human-brain-neuro-mapping-at-cellular-resolution-on-dgx/
Wed, 08 Nov 2023 03:42:55 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=8139
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為了在 2 年內對 100 個大腦進行全人腦細胞級成像以及后續的分析和映射,我們需要加速超級計算和計算工具。NVIDIA 的技術很好地滿足了這一需求,包括硬件、計算系統、高帶寬互連、特定領域的庫、加速工具箱、精心策劃的深度學習模型和容器運行時。NVIDIA 的加速計算涵蓋了 IIT Madras 大腦中心 的解決方案構建、推出、優化、管理和擴展的技術之旅。 如今,對于像蒼蠅這樣的小型昆蟲大腦,以及老鼠和小猴子的大腦,獲取、轉換、處理、分析和解釋的過程已經相當復雜。然而,對于整個人類大腦來說,這些活動規模更大、更復雜,更需要技能和時間。 IITM Brain Centre 的成像管線的關鍵大數據特征是體積 和速度。每個掃描儀的掃描速率為 250 GB/小時,當多個掃描儀同時運行時,該中心每小時能生成 2 TB 的高分辨率未壓縮圖像。所有圖像都必須進行處理,
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用 MONAI 和 RAPIDS 實時進行全幻燈片圖像分析
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/whole-slide-image-analysis-in-real-time-with-monai-and-rapids/
Thu, 13 Jul 2023 06:10:25 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=7453
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數字病理切片掃描儀生成大量圖像。載玻片通常以 40 倍的放大率進行掃描,得到千兆像素的圖像。壓縮可以將每個幻燈片的文件大小減少到 1 或 2 GB ,但這種數據量在移動、保存、加載和查看方面仍然具有挑戰性。要以全分辨率查看典型的完整幻燈片圖像,需要一個網球場大小的監視器。 與組織病理學一樣,基因組學和顯微鏡可以產生數兆字節的數據。有些用例涉及多種模式,將這些數據轉換為更易于管理的大小通常需要進行漸進式轉換,直到只保留最顯著的特征。本文探討了實現這種數據細化的一些方法,使用的分析類型,以及諸如MONAI和RAPIDS可以釋放有意義的見解。以一個典型的數字組織病理學圖像為例,因為這些圖像現在在全球的常規臨床環境中使用。 MONAI 是一套開源、免費的協作框架,旨在加速醫學成像領域的研究和臨床協作。 RAPIDS 是一套開源軟件庫,用于在 GPU 上構建端到端的數據科學和分析管道。
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用于醫學圖像分析的可視化基礎模型
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/visual-foundation-models-for-medical-image-analysis/
Tue, 20 Jun 2023 04:55:04 +0000
http://www.open-lab.net/zh-cn/blog/?p=7202
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3D 醫學圖像的分析對于提高臨床反應、疾病跟蹤和患者的整體生存率至關重要。深度學習模型構成了現代 3D 醫學表示學習的支柱,實現了對臨床決策至關重要的精確空間上下文測量。這些 3D 表示對醫學成像數據(例如 CT 或 MRI 掃描)的生理特性高度敏感。 醫學圖像分割是醫學應用的一項關鍵視覺任務,是測量醫學圖像各個方面的定量工具。為了改進對這些圖像的分析,基礎模型的開發和應用在醫學圖像分析領域變得越來越重要。 基礎模型是最新一代人工智能神經網絡,在廣泛多樣的數據集上進行訓練,可用于廣泛的任務或目標。 隨著大型語言模型展示其處理一般任務的能力,視覺基礎模型正在出現,以解決各種問題,包括分類、檢測和分割。 基礎模型可以用作強大的人工智能神經網絡,用于分割醫學圖像中的不同目標。它為醫學成像應用開辟了一個可能性的世界,增強了分割任務的有效性,并實現了更準確的測量。
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