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  • 數據科學

    AI 借助零采樣學習發現罕見疾病的現有治療藥物

    突破性的藥物再利用 AI 模型可以為醫生和患者帶來新的希望,讓他們嘗試在現有治療方案有限或根本沒有的情況下治療疾病。這個名為 TxGNN 的零樣本工具可幫助醫生找到現有藥物的新用途,以治療原本可能無法治療的病癥。

    這項研究 最近發表在 《自然醫學》 上,由哈佛大學的科學家領導,可能會減少藥物研發的時間和成本,從而更快地為患者提供有效的治療。

    哈佛大學醫學院 Blavatnik 研究所生物醫學信息學助理教授兼 Kempner 研究所副教授 Marinka Zitnik 在 最近的一篇新聞文章 中表示:“借助此工具,我們的目標是在各個疾病領域確定新的治療方法,但對于罕見、極為罕見和被忽略的疾病,我們預計該模型可以幫助縮小或至少縮小造成嚴重健康差距的差距。”

    全球有超過 3 億人患有 7000 多種罕見或未確診疾病。在這些罕見疾病中,大約 7% 的患者接受過 FDA 批準的藥物治療。這意味著許多患者都在等待并希望獲得新的治療方法。

    這種新的 AI 工具解決了當前大多數依賴已知藥物治療類似疾病的模型的局限性。由于缺乏數據,這些模型難以應對罕見和不太了解的疾病。

    TxGNN 通過使用圖神經網絡 (GNNs) 分析和識別大型醫療數據集 (包括疾病、藥物和蛋白質信息) 中的復雜關系和模式來克服這一問題。

    研究人員使用肯普納研究所的 AI 集群(包括 NVIDIA V100 Tensor Core GPU NVIDIA H100 Tensor Core GPU )來訓練和微調模型。據 Zitnik 稱,GPU 在處理涵蓋 17,080 種疾病和近 8,000 種藥物的大型醫學知識圖方面發揮了至關重要的作用。

    TxGNN 依靠圖神經網絡 (GNN) 對復雜的生物數據進行推理,并為專家生成透明的解釋,以審查其預測的見解。通過分析這些潛在聯系,AI 模型可以理解和預測藥物如何影響特定狀況。

    A workflow illustration showing how TxGNN reasons.
    圖 1. 顯示 TxGNN 模型中所用步驟的工作流 (Huang, K., Chandak, P., Wang, Q. )

    在測試中,AI 模型在沒有針對特定疾病進行訓練的情況下,將治療預測提高了 19%。在預測不應該使用藥物的情況下,AI 模型在預測禁忌癥方面的表現也優于現有模型。

    它的治療建議也與醫生經常開的藥物相匹配,即使這些藥物在特定情況下沒有獲得批準。

    訪問 TxGNN Explorer 以了解更多信息并體驗可視化界面。

    閱讀 哈佛醫學院 肯普納研究所 的新聞報道。

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